皮赘的大小、形状、性质各异。有些比较大，伴有水肿，质硬，呈紫色；有些像“大象耳朵”，偏平，基底较宽或者窄，质软，不痛。大的皮赘常常是肛瘘或肛裂痊愈后遗留下的病变。痔是扩张的血管团，因此一般情况下是质软、无痛的。痔常无特殊不适，但克罗恩病活动时可以变硬，伴有疼痛；克罗恩病引起严重腹泻时，可引起相应症状，如出血。
如果确定是“痔”，那么治疗方法包括坐浴、局部用药以及控制腹泻。由于手术切除常常可能导致伤口不愈合、感染、肛门狭窄、肛门括约肌损伤，一般应避免外剥内扎、套扎等痔手术。在无任何肛门直肠克罗恩病的情况下，对经过慎重选择的患者也可进行手术切除或套扎。
“肛裂”问题克罗恩病患者的肛裂分两种类型，也需要区分，治疗上也不太一样。第一种是原发性肛裂，也就是与克罗恩病没有关系的肛裂，具有一般肛裂的典型特征：溃疡表浅、位于正中线、从齿状线下延伸至肛管外缘。通常以下治疗对其有效，如坐浴、麻醉药、激素软膏和控制腹泻。原发性肛裂在克罗恩病中很少见。第二种是克罗恩病引起的肛裂，特点是溃疡深而宽，并且有时多发，常位于侧位（不在前正中位或者后正中位），远离正中线并且常伴有随其他肛周疾病。尽管这些肛裂病变看似严重，但一般不引起症状或症状轻微，多数克罗恩病引起的肛裂可自愈。
如有肛周活动性克罗恩病，可口服甲硝唑、5-氨基水杨酸灌肠或使用肛门栓剂，还可考虑使用免疫抑制剂。如肛裂引起疼痛，应注意有无脓肿或瘘管形成。如肛裂不愈合且症状持续，需排除直肠炎的可能。
对克罗恩病引起的肛裂病例，不应施行肛裂切除术。经内科治疗不愈合的肛裂，如无合并直肠炎，大部分可经内括约肌侧切术治愈。如不进行内括约肌切开，最终可能形成脓肿或肛瘘。如同时存在直肠炎。应避免手术。有极少部分的快了吧患者会出现一种特殊类型的肛管溃疡，溃疡面宽大而且呈穿透性，可累及大部分肛管，甚至呈环状，常规的局部治疗对其无效，这些患者最终常常需要切除直肠，并行粪便转流手术。
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